学院下设学生科（与共青团中国医科大学药学院委员会合署办公）、本科生党支部。学生科现有本科生专职辅导员2名，研究生专职辅导员1名，负责药学院本科生和研究生党团建设、思想政治教育、就业指导及日常管理工作。另有兼职辅导员若干名，负责学生的专业认识与科学研究工作。创建学院特色文化是我院学生工作的重要方向之一，通过举办各类医药学专业活动，加强同学们的专业认识及专业归属感。为丰富学生的大学生活，提高学生的综合能力，我院建立了完善的学生自我管理体系，努力营造一个温馨、团结的学院氛围。