中国医科大学医学教育评价与改革研究院前身是1981年成立的医学教育研究室；1984年发展成为原卫生部部属院校四个国家级医学教育研究中心之一。2017年为适应全球第三代医学教育改革，学校以医学教育研究中心为主体，整合中日医学教育中心和教育技术中心，成立了中国医科大学国际医学教育研究院。2024年更名为中国医科大学医学教育评价与改革研究院。