本着立足于产学研联合、服务于社会的运行规则，围绕重大慢性非传染性疾病防治等医学健康领域的重大问题，中国医科大学于2017年建立了健康科学研究院，作为科学研究的学术特区，实行PI制，开展科学研究联合攻关、协同创新工作，为我国的医学健康机构和相关企业的科技成果转化提供服务，成为一个面向辽宁省乃至全国医学健康领域的基础科研、新技术开发、技术指导和服务的平台和进行医学健康成果转化的核心基地。

研究院通过体制和机制创新，围绕“重大慢病发病机制与防控策略”等大卫生、大健康领域的关键科学问题，以“环境与慢病防治、离子稳态与蛋白质量构象病、代谢与相关疾病、健康大数据”为主要研究方向，将基础医学、预防医学、临床药学与临床医学有机结合，促进医学健康科学的研究水平和科研成果的应用转化，提升大型设备平台的共享服务水平。

研究院聚焦重大慢性非传染性疾病防治问题，凝练五大研究方向，涵盖恶性肿瘤、神经退行性疾病、代谢性疾病、心血管疾病以及交叉学科领域。现已入驻十余位PI、近60名团队成员，其中包括多位国家级高级人才。近年来研究院在国际顶级杂志Cell Research、Nature Communications、Science Advances、Lancet、PNAS等发表高水平学术论文，承担多项国家级重点科研项目，拥有多项自主知识产权发明专利，具备国际水平的科研与研发能力。研究院目前有国家级创新人才培养基地、重大慢病发病机制及综合诊疗医药基础研究创新中心、胃肠肿瘤精准诊疗教育部重点实验室等多个国家级科研平台及若干省部级科研平台，为科研创新提供坚实支撑。